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DNA混合图谱分型技术谈四-贡献者数量的相符合

2025-08-15 12:18:09

DNA混搭上图集中的开放源码为数该如何确定?

在对DNA混搭上图集完成拆分的时候,开放源码为数是个重要的参数,也许会对混搭上图集的拆分产生重要直接影响。

对于案件试样来说,只不过的开放源码为数往往是个“迷”,那么我们该如何对开放源码为数完成推算呢?确有好的方通则可以推定开放源码的为数,开放源码为数的计算方通则有:

;还有Maximum Allele Count (MAC) 最大基因型数通则

;还有Maximum Likelihood Estimation (MLE) 最大似然比推算通则

;还有Bayesian methods (e.g. NOClt) 贝叶斯通则

;还有Machine learning methods (e.g. PACE)

绝大多数比对人员使用MAC通则完成开放源码为数的推算,同时也将峰高信息作为考量状况独自完成推算,关于MAC方通则,我们可以通过下面这些文章完成了解。

有科学研究表明,如果另行使用MAC通则完成开放源码为数推定时,容易出现如下上图的情况下,随着开放源码为数的增加,MAC推定的结果也许会比具体开放源码为数极少1,唯如,4人混搭的试样,利用MAC通则完成推定的话78%的也许也许会算出3人混搭的结果;并且随着开放源码为数的增加,这种某种程度也也许会增加,6人混搭的试样,MAC推定的结果99.99%和85.99%的某种程度为5人混搭。

针对上述的情况下,我们可以通过回避更多的核苷酸完成推定,来降较差这种情况下的出现,或者将峰高回避于是就也也许会提高这种方通则的精确度。

我们独自来来归纳下,如何推定混搭试样中的开放源码为数:

1. 看上图集的质量,如果上图集质量极好,唯如,有严重影响的降解和可抑制周期性,随机逐次相比,剧中音量相比等,决定再一电泳检测;

2. 利用自己的资质,排除随机产生的信号和Stutter信息的直接影响;

3. 数出核苷酸下基因型的最大为数,然后四舍五入到都只的偶数,然后除以2,算出的就是小于的开放源码为数。

4. 试着把每个核苷酸下的基因型完成配对,如果配对的基因型峰高存在相比的不均衡,那么开放源码为数就加1;

5. 推算试样的混搭比唯,是否跟你推定的开放源码为数匹配。

我们来独自举唯说明一下:

唯1.

上图集质量:峰高没问题,剧中音量安静;

基因型为数:4个;

开放源码为数:2(4除以2);

混搭比唯:也许为3:1;

唯2.

上图集质量:剧中音量安静,峰高比较较差,有也许有随时逐次周期性;

基因型为数:4个;

开放源码为数:2(4除以2),存在不均衡周期性,2+1=3;也许是2人或者3人混搭;

开放源码比唯:2人混搭时,3:1; 3人混搭,2:1:微量;

唯3.

上图集质量:峰高没问题,剧中音量安静;

基因型为数:locus 1, 4个; locus 2, 3个;

开放源码为数:locus 1, 2(4除以2);locus 2, 2(3+1除以2);

混搭比唯:locus 1, 2:1; locus 2, 2:1;

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1. DNA混搭上图集搭桥技术谈一;还有-DNA混搭上图集比对究竟该回避哪些状况?

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4.云算GPM DNA混搭上图集比对系统

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